Divergent composition of the respiratory chain complexes | ||||||||||||||||||||||||||
Evers F, Cabrera-Orefice A, Elurbe DM, Kea-Te Lindert M, Boltryk SD, Voss TS, Huynen MA, Brandt U, Kooij TWA. Composition and stage dynamics of mitochondrial complexes in Plasmodium falciparum. Nat Commun. 2021 12(1):3820. PMID: 34155201 | ||||||||||||||||||||||||||
ETC Complex | Name | Gene ID | Annotation | Mol. Massa | EC# | Transcript | ||||||||||||||||||||
CII |
SDHA | PF3D7_1034400 | flavoprotein subunit of succinate dehydrogenase | 70.7 | 1.3.5.1 | |||||||||||||||||||||
SDHB | PF3D7_1212800 | 378 | 1.3.99.1 | |||||||||||||||||||||||
PfSDHC | PF3D7_1448900 | mitochondrial respiratory chain complex ii subunit, putative | 8.9 | |||||||||||||||||||||||
C2AP1 | PF3D7_0808450 | protein MPODD, putative | 10.6 | |||||||||||||||||||||||
C2AP2 | PF3D7_1322800 | mitochondrial respiratory chain complex ii subunit, putative | 14 | |||||||||||||||||||||||
C2AP3 | PF3D7_0109950 | mitochondrial respiratory chain complex ii subunit, putative | 19.5 | |||||||||||||||||||||||
C2AP4 | PF3D7_1346600 | mitochondrial respiratory chain complex ii subunit, putative | 26.7 | |||||||||||||||||||||||
Monomer | 188 | |||||||||||||||||||||||||
Trimer | 564 | |||||||||||||||||||||||||
CIII |
Cytb | PF3D7_MIT02300 | cytochrome b | 43.4 | ||||||||||||||||||||||
Cytc1 | PF3D7_1462700 | cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, putative | 46.1 | |||||||||||||||||||||||
Rieske | PF3D7_1439400 | cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, putative | 41 | 1.10.2.2 | ||||||||||||||||||||||
QCR6 | PF3D7_1426900 | cytochrome b-c1 complex subunit 6, putative | 11 | 1.10.2.2 | ||||||||||||||||||||||
QCR7 | PF3D7_1012300 | cytochrome b-c1 complex subunit 7, putative | 23 | 1.10.2.2 | ||||||||||||||||||||||
QCR8 | PF3D7_0306000 | cytochrome b-c1 complex subunit 8, putative | 17 | |||||||||||||||||||||||
QCR9 | PF3D7_0622600 | cytochrome b-c1 complex subunit 9, putative | 11.7 | 1.10.2.2 | ||||||||||||||||||||||
MPPalpha | PF3D7_0933600 | cytochrome b-c1 complex subunit 1, putative | 55.7 | 3.4.24.64 | ||||||||||||||||||||||
MPPbeta | PF3D7_0523100 | cytochrome b-c1 complex subunit 2, putative | 61.8 | 3.4.24.64 | ||||||||||||||||||||||
C3AP1 | PF3D7_0722700 | cytochrome b-c1 complex subunit 11, putative | 9.5 | |||||||||||||||||||||||
C3AP2 | PF3D7_1326000 | cytochrome b-c1 complex subunit 12, putative | 19.3 | |||||||||||||||||||||||
C3AP3 | PF3D7_0817800 | conserved Plasmodium protein, unknown function | 6.2 | |||||||||||||||||||||||
Dimer | 690 | |||||||||||||||||||||||||
CIV |
COX1 | mal_mito_2 | COX 1 cytochrome c oxidase subunit I | 57 | 1.9.3.1 | |||||||||||||||||||||
COX2a | PF3D7_1361700 | cytochrome c oxidase subunit 2a, putative | 27.3 | 1.9.3.1 | ||||||||||||||||||||||
COX2b | PF3D7_1430900 | cytochrome c oxidase subunit 2b, putative | 19.8 | 1.9.3.1 | ||||||||||||||||||||||
COX3 | mal_mito_1 | COX3 cytochrome c oxidase subunit 3 | 32.3 | 1.9.3.1 | ||||||||||||||||||||||
PfCOX4 | PF3D7_0708700 | Cox23 | 27.6 | |||||||||||||||||||||||
COX5b | PF3D7_0927800 | COX5B cytochrome c oxidase subunit 5B, putative | 32.4 | 1.9.3.1 | ||||||||||||||||||||||
PfCOX6a | PF3D7_1465000 | cytochrome c oxidase subunit apicox25, putative | 33.3 | 1.9.3.1 | ||||||||||||||||||||||
COX6b | PF3D7_0928000 | COX6b cytochrome c oxidase subunit 6B, putative | 12.2 | 1.9.3.1 | ||||||||||||||||||||||
PfCOX6c | PF3D7_0306500 | cytochrome c oxidase subunit apicox35, putative | 36.4 | |||||||||||||||||||||||
PfNDUFA4 | PF3D7_1439600 | COX26 | 22.6 | |||||||||||||||||||||||
ApiCOX13 | PF3D7_1022900 | COX13 CDGSH iron-sulfur domain-containing protein, putative | 13.9 | |||||||||||||||||||||||
ApiCOX14 | PF3D7_1339400 | COX14 cytochrome c oxidase subunit apicox14, putative | 17.8 | |||||||||||||||||||||||
ApiCOX16 | PF3D7_1345300 | conserved Plasmodium protein, unknown function | 10.2 | |||||||||||||||||||||||
ApiCOX18 | PF3D7_0523300 | COX18 cytochrome c oxidase subunit apicox18, putative | 16 | |||||||||||||||||||||||
ApiCOX19 | PF3D7_1402200 | cytochrome c oxidase subunit apicox19, putative | 22.1 | |||||||||||||||||||||||
ApiCOX24 | PF3D7_1362000 | COX24 | 23.8 | |||||||||||||||||||||||
ApiCOX30 | PF3D7_0915700 | COX30 | 22.4 | |||||||||||||||||||||||
C4AP1 | PF3D7_1125600 | conserved Plasmodium protein, unknown function | 10 | |||||||||||||||||||||||
C4AP2 | PF3D7_1025800 | conserved Plasmodium protein, unknown function | 8.2 | |||||||||||||||||||||||
C4AP3 | PF3D7_1003100 | conserved Plasmodium protein, unknown function | 10.7 | |||||||||||||||||||||||
C4AP4 | PF3D7_0608400 | conserved Plasmodium protein, unknown function | 12.7 | |||||||||||||||||||||||
C4AP5 | PF3D7_0809250 | conserved Plasmodium protein, unknown function | 7.9 | |||||||||||||||||||||||
Monomer | 476 | |||||||||||||||||||||||||
CV |
OSCP | PF3D7_1310000 | ATP synthase subunit o, mitochondrial, putative | 30.2 | 3.6.3.14 | |||||||||||||||||||||
ATPα | PF3D7_0217100 | ATP synthase subunit alpha, mitochondrial | 61.8 | 3.6.3.14 | ||||||||||||||||||||||
ATPβ | PF3D7_1235700 | ATP synthase subunit beta, mitochondrial | 58.4 | 3.6.3.14 | ||||||||||||||||||||||
ATPγ | PF3D7_1311300 | ATP synthase subunit gamma, mitochondrial | 35.8 | 3.6.3.14 | ||||||||||||||||||||||
ATPd | PF3D7_0311800 | ATP synthase F0 subunit d-like protein, putative | 73.5 | |||||||||||||||||||||||
ATPb | PF3D7_1125100 | ATP synthase F0 subunit b-like protein | 59.3 | |||||||||||||||||||||||
ATPk | PF3D7_0107400 | ATP synthase-associated protein, putative | 18.8 | |||||||||||||||||||||||
ATP i/j | PF3D7_1360000 | ATP synthase-associated protein, putative | 21.6 | |||||||||||||||||||||||
ATPδ | PF3D7_1147700 | ATP synthase subunit delta, mitochondrial, putative | 17.6 | 3.6.3.14 | ||||||||||||||||||||||
ATPε | PF3D7_0715500 | ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, putative | 8.5 | 3.6.3.14 | ||||||||||||||||||||||
ATPag | PF3D7_0719100 | ATP synthase F0 subunit a-like protein | 21.3 | |||||||||||||||||||||||
ATPcg | PF3D7_0705900 | ATP synthase subunit C, putative | 18.6 | 3.6.3.14 | ||||||||||||||||||||||
ATP8 | PF3D7_0934300 | ATP synthase-associated protein | 16.9 | |||||||||||||||||||||||
ATPTG2 | PF3D7_0611300 | ATP synthase-associated protein, putative | 33.5 | |||||||||||||||||||||||
ATPTG3 | PF3D7_0815400 | ATP synthase-associated protein, putative | 18.8 | |||||||||||||||||||||||
ATPTG4 | PF3D7_0905000 | conserved Plasmodium protein, unknown function | 34 | |||||||||||||||||||||||
ATPTG6 | PF3D7_1142800 | ATP synthase-associated protein | 35.5 | |||||||||||||||||||||||
ATPTG9 | PF3D7_1417900 | cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4, putative | 16.8 | |||||||||||||||||||||||
ATPTG10 | PF3D7_1024300 | ATP synthase-associated protein | 15.6 | |||||||||||||||||||||||
ATPTG12 | PF3D7_0620100 | ATP synthase-associated protein | 15.5 | |||||||||||||||||||||||
ATPTG13 | PF3D7_1303000 | ATP synthase-associated protein, putative | 13.8 | |||||||||||||||||||||||
ATPTG15 | PF3D7_0825400 | conserved apicomplexan protein, unknown function | 14.2 | |||||||||||||||||||||||
ATPTG17 | PF3D7_0306600 | ATP synthase-associated protein, putative | 9.9 | |||||||||||||||||||||||
Monomer | 1076 | |||||||||||||||||||||||||
Dimer | 2152 | |||||||||||||||||||||||||
a InkDa; estimates based on predicted amino acid composition, no post-translational modifications, cleavage events or lipid association were assumed. For complex mass estimation standard stoichiometry for conserved components (10× ATPc per CV monomer) and | ||||||||||||||||||||||||||
b Based on all samples. | ||||||||||||||||||||||||||
c Mean fitness scores as an indicator of P. falciparum gene essentiality. |